一般認為VSV是通過上皮和粘膜侵入機體的。病毒一旦侵入上皮層，即在皮內產生原發病變，同時在較深層的皮膚中，尤其是棘細胞層，病毒的復制更活躍。從病毒的復制到引起細胞溶解的過程會有滲出液蓄集，小水泡匯成大水泡。這一階段通常在實驗感染2-3天內發生。當病毒擴散到整個生發層后，似乎常破壞柱狀細胞層和基底膜，但并不明顯地破壞這些細胞的再生能力。雖然在真皮和皮下組織中有出 [3]血、水腫和白細胞浸潤，但病毒在這些區域通常并不造成原發性損傷。如果出現繼發感染，其損傷可能擴散到深層組織造成化膿和壞死。水泡性口炎在無并發癥的情況下，上皮細胞迅速再生，通常1-2周康復而不留疤痕。