臨床上若使用河鲀毒素劑量過大，會導致遠端神經受損，而神經損害可累及神經根、植物神經和中樞神經。因此，為了避免河鲀毒素在臨床應用中產生全身毒性反應，已研制出河鲀毒素微膠囊，將其分散地移植到坐骨神經的細胞膜下，既能起到局部麻醉的作用，又能降低對神經系統的毒性。河鲀毒素微膠囊的研發成功，可以使河鲀毒素在臨床上得到廣泛應用。河鲀毒素與神經變性有關。用河鲀毒素處理神經膠質細胞，導致692個細胞基因表達發生異常。因此，河鲀毒素作為一種神經毒素，為研究基因的表達規律及神經衰退機制提供了一條新途徑。另外，河鲀毒素還可治療與睡眠相關的疾病。在網狀腦橋嘴核和藍斑下核內微量注射河鲀毒素，它們的活性受到抑制，導致快速眼動睡眠時間和非快速眼動睡眠時間減少，證明河鲀毒素能降低腦橋區的活性，影響生物的睡眠—覺醒狀態。