以下按病變器官分類,并列出相關的主要臨床癥狀和常見疾病：
（一）食管疾病：主要癥狀為咽下困難、燒心、食物和酸反流。常見疾病有胃食管反流病、食管癌、食管賁門失弛緩癥。
（二）胃、十二指腸疾病：主要癥狀為上腹部不適、疼痛、惡心、嘔吐、噯氣、反酸、出血等。常見疾病有胃炎、消化性潰瘍、胃癌、十二指腸炎等。
（三）小腸疾病：主要表現有臍周腹痛、腹脹和腹瀉,糞便呈糊狀或水樣。慢性腹瀉可伴有全身性營養缺乏的表現。常見疾病有急性腸炎、腸結核、克羅恩病、吸收不良綜合征等。
（四）結腸疾病：主要癥狀有下腹部一側或雙側疼痛,腹瀉或便秘,黏液、膿血便,累及直腸時有里急后重。常見疾病有痢疾和各種結腸炎、腸易激綜合征、潰瘍性結腸炎、結腸癌、直腸癌、缺血性腸病等。
（五）肝臟疾病：主要臨床表現為肝區不適或疼痛、乏力常見。體征為肝大（或縮小）、肝區疼痛、黃疸、門靜脈高壓征和營養代謝障礙等。常見疾病有病毒性肝炎、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病、自身免疫性肝病、遺傳性肝病、藥物性肝病、肝膿腫、各種病因引起的肝硬化、原發性肝癌等。
（六）膽道疾病：主要臨床表現有右上腹疼痛（膽絞痛）和黃疸。常見疾病有膽石癥、膽囊炎、膽管炎、膽道蛔蟲癥、硬化性膽管炎等。
（七）胰腺疾病：主要臨床表現有上腹部疼痛（可向腰背部放射）和胰腺分泌障礙所引起的小腸吸收不良和代謝紊亂。常見疾病有急、慢性胰腺炎和胰腺癌。
（八）腹膜、腸系膜疾病：腹膜臟層形成一些消化器官的漿膜層。腹膜疾病的主要表現為腹痛與壓痛、腹部抵抗感和腹水等。常見疾病有各種急、慢性腹膜炎,腸系膜淋巴結結核,腹膜轉移癌等。