電噴霧離子化技術的突出特點是：可以生成高度帶電的離子而不發生碎裂，可將 質荷比降低到各種不同類型的質量分析器都能檢測的程度，通過檢測帶電狀態可計算離子的真實分子量，同時，解析分子離子的同位素峰也可確定帶電數和分子量。另外，ESI 可以很方便地與其它分離技術聯接，如液相色譜、 毛細管電泳等，可方便地純化樣品用于質譜分析。因此在藥殘、藥物代謝、蛋白質分析、 分子生物學研究等諸多方面得到廣泛的應用。其主要優點是：離子化效率高；離子化模式多，正負離子模式均可以分析；對蛋白質的分析分子量測定范圍高達105 以上；對熱不穩定化合物能夠產生高豐度的分子離子峰；可與大流量的液相聯機使用；通過調節離子源電壓可以控制離子的斷裂，給出結構信息。