本病淀粉樣蛋白在血管壁及組織中的沉積原因尚不明確，各種細胞因子，生長因子及有關炎癥介質，可能起著一定的作用，蛋白沉積主要發生在細胞外，造成組織損傷和功能障礙。
1.AL淀粉樣變病 此類淀粉樣纖維蛋白是從免疫球蛋白輕鏈衍生而來，稱AL，分子量為500～2500 Dα，通常含有免疫球蛋白可變區（V）的氨基末端和部分恒區（C），也可為完整的輕鏈，輕鏈主要有κ型和λ型兩種，表現為原發性或伴有多發性骨髓瘤及巨球蛋白血癥的淀粉樣變，此型漿細胞增生都很明顯，有報道在巨噬單核細胞，本-周蛋白經溶酶體內蛋白裂解酶作用后，可形成淀粉樣纖維蛋白。
2.AA淀粉樣變病 此類淀粉樣變是由被命名為AA蛋白的淀粉樣物質沉積于組織所造成，AA蛋白是由較大的前質降解而來，這種前質被稱為血清淀粉樣蛋白A相關蛋白，簡稱SAA，它的產生與免疫球蛋白無關，在慢性病程中，SAA產生過多，超過了機體的降解能力，形成過多的AA蛋白而沉積于組織中，SAA可能由巨噬細胞，單核細胞及白細胞合成，并受白細胞介素6興奮，白細胞介素Ⅰ及腫瘤壞死因子介導，AA蛋白沉積形成繼發性淀粉樣變，常見于下列情況：
（1）慢性感染：包括結核病，骨髓炎，慢性腎盂腎炎，慢性褥瘡，支氣管擴張，瘤型麻風，血吸蟲病等。
（2）風濕病：類風濕關節炎，強直性脊柱炎，系統性紅斑狼瘡，結節病，皮肌炎，節段性腸炎，潰瘍性結腸炎，斯梯爾病，免疫母細胞性淋巴結病，白塞病等。
（3）惡性腫瘤：霍奇金病，淋巴肉瘤，肺癌，食管癌，直腸癌，胃癌，網狀細胞肉瘤，淋巴細胞肉瘤，宮頸癌等。
（4）其他：麻醉藥成癮，囊腫纖維化及周期性粒細胞減少癥等。
3.老年性淀粉樣變 病因不清，最近的資料顯示，這些纖維蛋白可能由各種組織特異性蛋白轉化而來，其結構和抗原性也不同于其他淀粉樣蛋白。