（1）對深部厭氧菌感染的治療應包括膿液引流和外科手術切除失活組織，抗生素配合外科手術有助于控制菌血癥，減少繼發性或遷徙性化膿并發癥，并能防止手術部位周圍的感染局部擴散。
（2）混合感染某些菌株對抗生素耐藥，抗菌療法也仍可見效，特別當給予充分引流時，效果更好，處理混合感染中的厭氧菌可減少傷口中細菌的數量，也可減少膿腫形成的數量。膿腫或容易感染的部位，如穿孔的器官必須關閉或引流，失活的組織、異物和壞死組織必須清除，任何封閉腔隙的感染如膿胸必須引流，若可能應重建血液供應的循環，對膿毒性血栓性靜脈炎需結扎靜脈并給抗菌治療。