預防特發性功能性低血糖癥發作就是特發性功能性低血糖癥的最佳治療。預防的重點在于普及糖尿病教育，使病人及家人掌握糖尿病的基本知識，充分了解低血糖反應的癥狀，學會自救和自作微量法快速血糖檢測，養成良好的生活習慣，戒煙戒酒。因某些原因不能進食或運動量增加時要及時調整胰島素等藥劑量。病人外出進入要隨身攜帶糖果、餅干等食品，以便自救。具體的方法可以去除誘因和合理用藥兩方面去做。
1.避免誘發因素
(1)飲食不當：
(2)運動不當
(3)合并腎動能不全
(4)脆性糖尿病病人
2.合理用藥用藥不合理是發生特發性功能性低血糖癥的主要原因。對于糖尿病的治療要個體化，不同的時期病程的長短，合并并發癥的不同，以及年齡、體形等的差異，選擇應用針對性的降糖藥物。應嚴格掌握各種降糖藥物的適應證。