認為特發性癲癇綜合征大多數具有單基因遺傳背景。
1、良性家族性新生兒癲癇(benignfamilialneonmalconvulsion，BFNC)是常染色體顯性遺傳存在遺傳異質性，20世紀80年代基因連鎖分析多個家系基因定位在20號染色體20q13.3，20世紀90年代證明一個墨西哥-美洲起源家系發病與8號染色體長臂連鎖將20q命名為EBN18q命名為EBN2家系研究表明，良性家族性嬰兒癲癇基因定位于19號染色體短臂。
2、兒童良性中央顳區癲癇(benignrolanticepilepsyofchildhoodBRE)又稱具有中央-顳部棘波的良性兒童期癲癇(benignchildhoodepilepsywithcentro-temporalspike,BECTS)屬特發性部分性癲癇為常染色體顯性遺傳。
3、兒童良性枕葉癲癇(benignoccipitallobusepilepsyofchildhood)為常染色體顯性遺傳可能是良性中央顳區癲癇的變異型。
4、兒童失神性癲癇(childhoodabsenceepilepsy)又稱為密集性癲癇(pyknolepsy)，呈常染色體顯性遺傳，伴外顯率不全占全部癲癇患者的5%～15%。
5、青少年失神性癲癇(juvenileabsenceepilepsy)與肌陣攣失神癲癇(myoclonicabsenceepilepsy)病因可能為異質性某些病例可能為遺傳性，有些可能是某種腦病的癥狀。
6、青少年肌陣攣癲癇(juvenilemyoclonicepilepsy，JME)近年來對上百個JME家系調查發現，先證者同胞80%出現癥狀，家系成員除表現JME，可有失神發作和GTCS等。115個JME家系基因連鎖分析發現相關基因與6號染色體短臂6p21.3緊密連鎖命名為EJM1提示本病呈常染色體隱性遺傳傾向。