海洋及其他環境中可以分離出能夠降解瓊脂的瓊脂糖酶.按照作用方式的不同,可將瓊脂糖酶分為α-瓊脂糖酶和β-瓊脂糖酶兩種類型。不同的瓊脂糖酶具有不同的生物學特性。瓊脂糖酶在海藻單細胞的制備、海藻原生質體的制備、瓊脂寡糖的制備、海藻多糖結構的研究及分子生物學研究方面具有重要的應用價值。