健康危害
甲醇被大眾所熟知，具有毒性。工業酒精中大約含有4%的甲醇，若被不法分子當作食用酒精制作假酒，飲用后，會產生甲醇中毒。甲醇的致命劑量大約是70ml。
甲醇的毒性對人體的神經系統和血液系統影響最大，它經消化道、呼吸道或皮膚攝入都會產生毒性反應，甲醇蒸氣能損害人的呼吸道粘膜和視力。在甲醇生產工廠，中國有關部門規定，空氣甲醇的濃度限制為PC-stel=50mg/m3，PC-TWA=25mg/m3，在有甲醇氣的現場工作須戴防毒面具、工廠廢水要處理后才能排放，允許含量小于200mg/L的甲醇。
甲醇的中毒機理是，甲醇經人體代謝產生甲醛和甲酸（俗稱蟻酸），然后對人體產生傷害。常見的癥狀是，先是產生喝醉的感覺，數小時后頭痛，惡心，嘔吐，以及視線模糊。嚴重者會失明，乃至喪命。失明的原因：甲醇的代謝產物甲酸累積在眼睛部位，破壞視覺神經細胞。腦神經也會受到破壞，而產生永久性損害。甲酸進入血液后，會使組織酸性越來越強，損害腎臟導致腎衰竭。
毒性：屬低毒毒性。
急性毒性：LD50：5628mg/kg（大鼠經口），15800mg/kg（兔經皮）；LC50：82776mg/kg，4小時（大鼠吸入）；人經口5～10ml，潛伏期8～36小時，致昏迷；人經口15ml，48小時內產生視網膜炎，失明；人經口30～100ml中樞神經系統嚴重損害，呼吸衰弱，死亡。
亞急性和慢性毒性：大鼠吸入50mg/m3，12小時/天，3個月，在8～10周內可見到氣管、支氣管粘膜損害，大腦皮質細胞營養障礙等。
致突變性：微生物致突變：啤酒酵母菌12pph。DNA抑制：人類淋巴細胞300mmol/L。
生殖毒性：大鼠經口最低中毒濃度（TDL0）：7500mg/kg（孕7～19天），對新生鼠行為有影響。大鼠吸入最低中毒濃度（TCL0）：20000ppm（7小時，孕1～22天），引起肌肉骨骼、心血管系統和泌尿系統發育異常。
接觸限制
甲醇對人體有低毒，因為甲醇在人體新陳代謝中會氧化成比甲醇毒性更強的甲醛和甲酸（蟻酸）。
初期中毒癥狀包括心跳加速、腹痛、上吐（嘔）、下瀉、無胃口、頭痛、暈、全身無力。嚴重者會神智不清、呼吸急速至衰竭。失明是最典型的癥狀，甲醇進入血液后，會使組織酸性變強產生酸中毒，導致腎衰竭。最嚴重者是死亡。
然而，仍然有不少不法商人不顧生命安全，用含有甲醇的工業酒精勾兌假酒并出售。但是，正品酒中也有極微量的甲醇，是宿醉的原因之一。甲醇中毒可以用乙醇解毒。因為甲醇在肝臟中被酒精脫氫酶氧化成甲醛，然后形成甲酸。乙醇可以和甲醇競爭醇脫氫酶，而使人體有時間排除甲醇。