皂甙是一類極性較強的大分子化合物，不容易結晶，易溶于水和醇，難溶于有機溶劑，而且在同一植物中往往有很多結構相近的皂甙共存，更增加了分離純化的困難。一般采取先用甲醇或含水乙醇提取，然后將醇浸膏懸浮于水，用水飽和的正丁醇萃取，即得到總皂甙。粗皂甙的分離除使用常規的正相硅膠柱層析外，還可選用反相硅膠、大孔吸附樹脂及葡聚糖凝膠柱層析等，可使分離效果顯著提高。反相柱層析在皂甙的分離和純化時使用比較多，最常用的是ODS （C18反相填料），該法主要選用水和醇以不同的比例洗脫，對于極性大的化合物有較好的分離效果，而且對樣品的吸附比較少，可減少樣品損失。凝膠柱層析是60年代發展起來的分離水溶性化合物的常用方法，主要根據分子大小進行分離。當植物提取物中同時含皂甙、黃酮、香豆精及內酯等成分時，可用Sephadex LH-20進行組分分離。大孔吸附樹脂為多孔性的聚合體,常用的有Diaion HP-20, D-101，RA樹脂，一般用于皂甙的粗分。將醇提物懸浮于水，直接通過大孔吸附樹脂柱，皂甙被吸附，再用不同濃度的醇洗脫，可將總皂甙分成幾部分，而且可以有效去除葉綠素。有時僅靠一種柱層析的方法很難解決所有的分離問題，所以要得到一個純皂甙往往需要幾種方法配合使用，才能達到滿意的分離效果。隨著各種新型填料的出現，皂甙的提取、分離及純化目前已達到高效、快速，可在短時間內從同一植物中分離一系列結構及化學性質極為相近的皂甙。劉承來等[3～5]從叉蕊薯蕷的根莖中分離得到4個約莫皂甙元(yamogenin)的甾體皂甙，又從盾葉薯蕷的根莖中得到5個甾體皂甙，甙元為薯蕷皂甙元(diosgenin)。此外，我們從東一號劍麻葉汁的發酵物中分離到5個替告皂甙元(Tigogenin)的多糖甙[6，7]。