1.流行性乙型腦炎：夏季發病，兒童多見，乙腦補體結合試驗或血凝抑制試驗陽性。
2.流行性腦脊髓膜炎：好發于冬、春季節，兒童多見，腦膜刺激征明顯，早期即可出現皮膚瘀斑、瘀點，取標本涂片檢查可找到腦膜炎雙球菌。腦脊液檢查壓力明顯升高，外觀混濁，細胞數增多明顯，以中性粒細胞為主，蛋白增高，糖及氯化物減少，腦脊液涂片或培養可發現腦膜炎雙球菌。
3.結核性腦膜炎：起病緩慢，可有他處結核病灶。腦脊液壓力升高，蛋白增高，糖及氯化物減少，靜置后有蛛網膜狀物形成。離心涂片抗酸染色可檢出結核桿菌。
4.腦梗死：梗死灶按血管供應分布，腦梗死起病急，有腦卒中表現。
5.多發性硬化，病灶常垂直與側腦室壁分布，急性期DWI呈等或低信號，環形或結節狀強化，病程呈緩解復發交替。
6.化膿性腦膜腦炎：起病相對較急，臨床癥狀多數更顯著，多由鄰近器官感染擴散而來或顱外感染灶血行播散至腦；腦脊液葡萄糖含量明顯降低，白細胞明顯升高，這些在急性病毒性腦膜腦炎改變不明顯。