主要是腎小球濾過和腎小管重吸收障礙的結果。其特點常為持續性的，蛋白量較多。且常伴有紅細胞尿、白細胞尿、管型尿及相應臨床表現。可分為腎前性、腎性、腎后性蛋白尿。
1、腎前性蛋白尿
多為溢出性蛋白尿，是由于血液流經腎臟前的疾病引起，例如多發性骨髓瘤、骨骼肌嚴重損失、急性溶血等，這些疾病導致尿中出現大量低分子量蛋白。如本-周蛋白、肌紅蛋白及血紅蛋白。
2、腎性蛋白尿見于腎小球或腎小管疾病。
（1）腎小球性蛋白尿：
是因炎癥、中毒等原因導致濾過孔徑或電荷屏障破壞，出現通透性增加至血漿蛋白大量濾出，其中70%~80%是白蛋白大量進入Bowman囊，超過近端腎小管對蛋白質的重吸收所致蛋白尿，以白蛋白為主，尿蛋白含量常≥2g/24h或≥40mg(/m2·h)；
（2）腎小管性蛋白尿：是近曲小管對低分子量蛋白重吸收功能減退而致的蛋白尿，以β2微球蛋白、α1微球蛋白、視黃醇結合蛋白、溶菌酶等增多為主，一般尿蛋白含量較低，常<2g/24h或<40mg(/m2·h)；
（3）混合性蛋白尿：腎小球與腎小管同時受累導致的蛋白尿，尿中低分子量和中分子量蛋白同時增多，甚至可見大分子免疫球蛋白；
（4）組織性蛋白尿：是腎小管代謝和腎組織破壞分解產生的蛋白，由于炎癥等因素導致此類蛋白排出增多形成的蛋白尿，見于重度腎小管炎癥。
3、腎后性蛋白尿尿中混有多量血、膿、黏液等成分導致尿蛋白定性陽性，主要見于泌尿道炎癥、結石、腫瘤、損傷出血等，一般不伴有腎臟本身損害。