1、西醫治療：
西醫認為子宮內膜異位癥的發生、發展和消退是在內分泌控制下進行的，因此，應用激素治療有效。治療目的為治愈疾病、防止復發、促進生育。藥物治療效果以輕、中度內異癥為佳，可緩解癥狀，增加受孕率;重癥患者病灶較大，纖維化多，粘連緊密。尚需手術治療。
2、中醫治療：
中醫認為盆腔子宮內膜異位癥發病與月經周期有密切關系，治療痛經結合月經時期及不同體質論治。一般經前以調氣化瘀為主;經期以活血化瘀、理氣止痛為主;經后以益氣補腎、活血化瘀為主。若伴月經過多，在月經期尚需化瘀止血。子宮內膜異位癥諸多癥狀表現其直接發病，病機為“血瘀”，而“血瘀”又有寒、熱、虛、實之區別。臨床治療在立足于基本病機的基礎之上，又應當辯其虛實夾雜，特別是針對其臨床主要的癥狀表現，結合適當的辯病與辯證相結合，或補腎、活血化瘀以調經、或補腎活血促排卵助孕、或活血化瘀散結。
本病非單純氣血瘀滯，而屬虛實夾雜，本虛標實之證，在本者為脾腎之虛，在標者為氣滯血瘀，故溫宮內異湯治療上采用標本兼治之法。