1.實驗室檢查
真菌性關節炎在滑膜和關節液中可找到致病真菌。滑膜組織培養比關節液培養陽性率高。如念珠菌病,孢子絲菌病的滑膜液病原菌培養大多是陽性。
2.其他輔助檢查
X線攝片,表現為骨質溶解或骨溶解和骨硬化同時存在。但X線表現很難與其他肉芽腫性關節炎相區別。如念珠菌病X線攝片檢查可見2/3患者鄰近關節處有骨髓炎。滑膜液病原菌培養陽性可以明確診斷。