減弱呼吸：呼吸抑制是服用所有嗎啡制劑的主要危險。它主要發生在年老、體弱和伴有缺氧或高碳酸血癥的患者身上。對于這些患者即使給予最合適治療劑量的嗎啡也有降低肺通氣量的危險。對于患有慢性阻塞性肺疾病或肺活量低的患者、呼吸儲備明顯減少的患者、缺氧、高碳酸血癥或先前存在呼吸抑制的患者，在使用嗎啡時要格外慎重。因為對于這樣的患者即使給予常規治療劑量的嗎啡也會降低呼氣力、增加吸氣阻力而導致呼吸停止。
頭部損傷和顱內壓升高：由于二氧化碳儲留、繼發的腦脊液壓力升高和呼吸抑制使得頭痛、顱腦損傷或已經存在的顱內壓增高進一步惡化。對于有顱腦損傷的患者，嗎啡能混淆由于顱內壓進一步增高帶來的神經癥狀。
低血壓效應：同所有阿片類藥物一樣，對于那些血容量低到不足以維持其血壓或服用吩噻嗪類藥物或全身麻醉劑的患者，給予硫酸嗎啡能給患者造成嚴重的低血壓。硫酸嗎啡能使非臥床的患者產生體位性低血壓。同所有阿片類藥物一樣，對患有循環休克的患者應慎用硫酸嗎啡，因為該藥引起的血管舒張可能進一步降低心輸出量和血壓。
同其它中樞神經抑制劑的相互作用：同所有阿片類止痛劑一樣，對同時接受其它中樞神經抑制劑（包括鎮靜催眠劑、全身麻醉劑、吩噻嗪類、其它鎮靜劑和酒精）的患者，在使用硫酸嗎啡時要慎用和減量，因為這些藥物可能會導致呼吸抑制、低血壓、深度鎮靜或昏迷。
同激動/拮抗混合型阿片類止痛藥的相互作用：理論上說當患者已經接受或正在接受純激動型阿片類止痛藥物治療時不應給予激動/拮抗混合型鎮痛藥（如：噴他佐辛、納布啡、布托啡諾、丁丙諾啡）。這些患者使用此類止痛藥物，可以導致鎮痛效果降低或突然出現戒斷癥狀。
藥物依賴性：服用嗎啡可產生藥物依賴性且有被濫用的可能。重復給藥后產生耐受性以及精神和軀體的依賴性。但是對于疾病晚期或有嚴重疼痛的患者，出現身體上的依賴性并不非常重要。長期服用后如果馬上停藥或者突然減量會導致戒斷癥狀出現。長期服用阿片類止痛藥若要停藥，必須逐漸減量。對阿片類止痛藥有軀體依賴性的母親生下的嬰兒也存在軀體依賴性、呼吸抑制和戒斷癥狀。