核基因hnRNA內含子的剪接點序列為…外顯子…↓GU…內含子…AG↓…外顯子…,這就是普遍適用的所謂Breathnach-Chambon規則(GU-AG規則)(GU-AG rule),此規律不適合于線粒體和葉綠體的內含子,也不適合于tRNA和某些編碼rRNA的核結構基因,酵母的分支位點序列是高度保守的,其共有序列為UAC-UAAC。剪接點序列和分支位點保守序列在hnRNA剪接中非常重要,如果這兩個保守序列突變就不能正確的剪接hnRNA。然而,單靠這樣簡單的保守序列是不可能做到hnRNA正確剪接,snRNA參與了這種作用。