棘球蚴生長緩慢，在較長時間內無癥狀或體征且臨床表現及其復雜。故早期難以確診。在流行區應警惕此病的可能。首先應詢問病史，了解病人是否來自流行區，是否與犬、羊等動物或皮毛接觸史。可疑者可采用X線、B超、CT、MR（磁共振）及同位素掃描等物理診斷方法，特別是CT和MR，不僅可早期診斷處無癥狀的帶蟲者，且能準確地檢測出各種病理形態影像。但這些方法均難以對病變的性質作出明確的診斷。而且有的方法費用較高，確診應以病原學結果為依據，如手術取出棘球蚴，或從痰、胸腔積液、腹水或尿等棘球蚴碎片或原頭蚴等。 血清學實驗是常用的重要輔助診斷和流行病學調查的方法。主要有：
1.卡松尼（Casoni）批內實驗 方法簡便，15分鐘即可得出結果，陽性率78.6%－100%，但易出現假陽性（約18%－67%）或假陰性，已漸少用。
2.酶聯免疫吸附實驗（ELISA）敏感且特異性較高，已有試劑盒供使用。
3.間接血凝實驗（IHA）陽性率達80%，但敏感性低于ELISA。
4.親和素－生物素－酶復合物酶聯免疫吸附實驗（ABC－ELISA）敏感性最高比常規ELSA高4－6倍且假陽性很少。
5.斑點酶聯免疫吸附實驗（Dot－ELISA）從操作簡便、易觀察，很適于基層使用。 此外尚有對流免疫電泳（CIEP）、間接熒光體實驗（IFA）、膠乳凝集實驗（LAT）應采取綜合方法。用2－3項血清學實驗相互彌補不足，以提高準段準確率。