1、用于促進排卵時，較多見者為誘發卵巢囊腫或輕度到中度的卵巢腫大，伴輕度胃脹、胃痛、盆腔痛，一般可在2-3周內消退。少見者為嚴重的卵巢過度刺激綜合征，由于血管通透性顯著提高而致體液在胸腔、腹腔和心包腔內迅速大量積聚引起多種并發癥，如血容量降低、電解質紊亂、血液濃縮、腹腔出血、血栓形成等。臨床表現為腹部或盆腔部劇烈疼痛、消化不良、浮腫、尿量減少、惡心、嘔吐或腹瀉、氣促、下肢腫脹等。往往發生在排卵后7-10天或治療結束后，反應嚴重可危及生命。
2、用于治療隱睪癥時偶可發生男性性早熟，表現為痤瘡、陰莖和睪丸增大，陰毛生長增多，身高生長過快。
3、較少見的不良反應有：乳房腫大、頭痛、易激動、精神抑郁、易疲勞。
4、偶有注射局部疼痛、過敏性皮疹。
5、用本品促排卵可增加多胎率或新生兒發育不成熟、早產等。