維生素B6缺乏者可出現虛弱、無表情、精神萎靡、嗜睡、憂郁、失去責任感、神經質、易激惹，少數有感覺型周圍神經病變，繼之發生運動功能欠佳、步履困難、體重下降，嬰兒可出現抽搐。
眼、鼻兩側脂溢性皮炎樣改變，并可擴展至口周、面部、前額、耳后、陰囊和會陰，在乳房下和潮濕部位可有皮膚擦爛。頸項、前臂和膝部色素沉著，前額痤瘡樣損害，并有唇炎、舌炎、口腔炎和舌乳頭肥大。
患者免疫力降低，易發生感染，尤為泌尿生殖系統感染。亦可發生小細胞低血素性貧血和巨成紅細胞性貧血。
