綠色熒光蛋白(Green fluorescent protein，簡稱GFP)，是一個由約238個氨基酸組成的蛋白質，從藍光到紫外線都能使其激發，發出綠色熒光。雖然許多其他海洋生物也有類似的綠色熒光蛋白，但傳統上，綠色熒光蛋白（GFP）指首先從維多利亞多管發光水母中分離的蛋白質。這種蛋白質最早是由下村脩等人在1962年在維多利亞多管發光水母中發現。這個發光的過程中還需要冷光蛋白質水母素的幫助，且這個冷光蛋白質與鈣離子可產生交互作用。
在維多利亞多管發光水母中發現的野生型綠色熒光蛋白，395nm和475nm分別是最大和次大的激發波長，它的發射波長的峰點是在509nm，在可見光譜中處于綠光偏藍的位置。綠色熒光蛋白的熒光量子產率（QY）為0.79。而從海腎(sea pansy)所得的綠色熒光蛋白，僅在498nm有一個較高的激發峰點。
在細胞生物學與分子生物學中，綠色熒光蛋白(GFP)基因常用做報告基因(reporter gene)。綠色熒光蛋白基因也可以克隆到脊椎動物(例如:兔子)上進行表現，并拿來映證某種假設的實驗方法。通過基因工程技術，綠色熒光蛋白(GFP)基因能轉進不同物種的基因組，在后代中持續表達。現在，綠色熒光蛋白(GFP)基因已被導入并表達在許多物種，包括細菌，酵母和其他真菌，魚（例如斑馬魚），植物，蒼蠅，甚至人等哺乳動物的細胞。
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