1.首先要與中樞神經系統其他感染鑒別 結核性腦膜炎、真菌性腦膜炎和病毒性腦膜炎相鑒別：根據病史，臨床表現及腦脊液改變的不同特點，一般不難鑒別。幾種常見腦膜炎的腦脊液鑒別要點如表1所示。
2.與其他非中樞神經系統感染疾病鑒別 腦血管病，尤其是蛛網膜下腔出血；糖尿病酮癥酸中毒；感染中毒性腦病；顱內占位性病變。同樣依靠病史、臨床表現、腦脊液改變以及影像學檢查CT掃描，可以鑒別。
