1.動眼神經麻痹 常見于腦動脈瘤、中腦占位病變和糖尿病患者，除有上瞼下垂，眼球活動受限、復視外，常有瞳孔異常改變，且癥狀無波動性。
2.延髓性麻痹 延髓肌型MG需與腦干腫瘤或腦干腦炎引起的真性延髓性麻痹和雙側錐體束損害引起的假性延髓性麻痹相鑒別。真性延髓性麻痹者咽反復減弱或消失，假性延髓性麻痹者常有多次卒中史，伴強哭強笑，體檢可見雙側錐體束征。
3.Lambert-Eaton綜合征 該綜合征以男性居多，約2/3的患者伴發小細胞型肺癌或腸腺癌，肌無力以四肢為著，稍事活動后肌無力癥狀可減輕，新斯的明試驗有時呈陽性反應，神經低頻電重復刺激試驗常陰性，AchRab滴度正常，用鹽酸胍治療有效。