1.大便異常
肛裂首先是因為來自外力的沖擊或摩擦。如果糞便過粗過硬，此時肛門適應性較差，會使肛管裂開，有人研究發現，不僅是便秘，腹瀉也會產生肛裂，可占到肛裂誘因的4%～7%。
2.內括約肌痙攣
腸道、肛管或肛竇的炎癥刺激、酸性糞便刺激、括約肌外露、氣憤緊張等異常情緒，均可引起肛門內括約肌張力高，可造成肛管靜息壓明顯增高，如此時肛門的舒展性不夠，當干硬的糞便通過時，會產生裂口。
3.解剖缺陷
肛門外括約肌在肛管前后形成兩個三角形裂隙，對肛管缺乏足夠的支撐，但糞便撞擊時可產生裂。同時肛門動脈從兩側向中間分布，在肛門前后交叉，結果在肛門前后形成兩個分布薄弱區，導致此區供血亦較差。肛管與直腸成90度角相延續，排便時肛管后壁承受壓力最大，故后正中線處最易發生肛裂。