經皮肝穿刺是根據負壓吸引的原理， 采用快速穿刺方法，從肝內抽取少量的肝組織，直接在顯微鏡下觀察其組織形態的改變，再結合臨床資料，作出肝病的診斷。但由于所得標本較小，尚難完全代表肝臟的全部病變。不過像病毒性肝炎、脂肪肝、各種類型的肝硬化等，其肝臟病變呈彌漫性，故雖取出的肝組織較小，也能比較準確地反映出病變的性質和程度。同時，快速肝穿刺術操作簡單，只要嚴格按照操作規程，是比較安全可靠的，發生并發癥的機會很少。所以，肝穿刺仍是診斷疾病的一個比較有價值的方法。
肝穿刺活檢細胞學檢查是確診脂肪肝的唯一方法。多在B超引導下進行肝穿刺，抽吸肝組織活檢，遠較過去的盲目肝穿刺法準確安全，尤其對于局灶性脂肪肝或彌慢性脂肪肝伴正常肝島與B超下肝癌鑒別有困難時具有獨特的優越性。通過對活檢組織顯微鏡下觀察可以明確脂肪肝病變程度、類型、有無合并脂肪性肝炎和肝纖維化。這對病人的治療以及預后判斷亦有重要價值。但由于它是一種創傷性檢查。病人難以接受，普及相對比較困難。