錦鯉由腸型點狀氣單胞菌引起。該菌是條件致病菌,在普通水體及池底淤泥中常有大量存在,也存在于健康魚體的腸道中,但是數量不多。當錦鯉生活環境條件惡化,魚體抵抗力下降時,該菌則可以在腸道內大量繁殖,導致發病。病原菌隨病魚及帶菌魚的糞便排到水中,污染飼料,經口感染。