1.瘺口
腹壁有一個或多個瘺口，有腸液、膽汁、氣體或食物排出，是腸外瘺的主要臨床表現。手術后腸外瘺可于手術3～5天后出現癥狀，先有腹痛、腹脹及體溫升高，繼而出現局限性或彌漫性腹膜炎征象或腹內膿腫。術后1周左右，膿腫向切口或引流口穿破，創口內即可見膿液、消化液和氣體排出。較小的腸外瘺可僅表現為經久不愈的感染性竇道，于竇道口間歇性地有腸內容物或氣體排出。嚴重的腸外瘺可直接在創面觀察到破裂的腸管和外翻的腸黏膜，即唇狀瘺；或雖不能直接見到腸管，但有大量腸內容物流出，稱管狀瘺。由于瘺口流出液對組織的消化和腐蝕，再加上感染的存在，可引起瘺口部位皮膚糜爛或出血。
2.營養物質吸收障礙
腸外瘺發生后，由于大量消化液的丟失，患者可出現明顯的水、電解質紊亂及酸堿代謝失衡。由于機體處于應激狀態，分解代謝加強，可出現負氮平衡和低蛋白血癥。嚴重且病程長者，由于營養物質吸收障礙及大量含氮物質從瘺口丟失，患者體重可明顯下降、皮下脂肪消失或骨骼肌萎縮。
3.感染
在腸外瘺發展期，可出現腸袢間膿腫、膈下膿腫或瘺口周圍膿腫，由于這些感染常較隱蔽，且其發熱、白細胞計數增加、腹部脹痛等常被原發病或手術的創傷等所掩蓋，因此，很難在早期作出診斷及有效的引流。