肱骨遠端骨骺分離需與下面的幾個疾病進行鑒別：
1.肘關節脫位
在肱骨小頭骨化中心出現之前，該年齡組骺板強度較關節囊及韌帶結構薄弱，脫位可能性極小，同時缺乏肘脫位時關節的彈性固定及肘后三角關系異常的臨床表現。在肱骨小頭骨化中心出現以后，如若橈骨縱軸延線通過骨化中心，肘脫位即可排除。
2.肱骨內髁或外髁骨折
此時骨折塊大多側方或/和旋轉移位，尺橈骨近端與肱骨無分離移位，肘后三角異常。壓痛限局于關節外側，有時可觸到外髁異常活動。X線攝片示：肱骨干與尺橈骨對線關系正常而肱骨外髁向外側移位。
3.肘關節脫位合并肱骨外髁或肱骨內髁骨折
此時骨折塊通常向后外或后內移位，復位容易，復位后骨折線清晰，肘后三角關系異常。
4.肱骨髁間骨折
此時肱骨內外髁分離移位，尺橈骨近端與肱骨距離變短。
5.肱骨外髁未骨化
X線表現與全骺分離鑒別困難。發病年齡與移位方向可作參考。肘關節常見為外側脫位，全骺分離遠段往往內移。根據整復過程中的“手感”有助于鑒別診斷。肱骨外髁已骨化后，其X線影像可作為診斷依據。
6.外髁骨折合并肘關節脫位
極少見，偶見于學齡后的兒童。臨床表現兼有外髁骨折與肘關節脫位的特征。如肱骨外髁與橈骨近端對位，多為全骺分離。