人對HFRS病毒普遍易感。過去認為HFRS以顯性感染為主，但近年來的監測研究表明，人群感染后僅少數人發病，大部分人呈隱性感染狀態，特別是Ⅱ型疫區的人群隱性感染率更高。感染后抗體出現早，發熱1～2天即可檢測出lgM抗體，第7～10天達高峰；第2～3天可檢測出lgG抗體，第14～20天達高峰，lgG抗體在體內可持續存在30余年。近年來的研究結果表明，在不同的抗體成份中，對機體起免疫保護作用的主要是由G1和G2糖蛋白刺激產生的中和抗體和血凝抑制抗體，而由N蛋白刺激產生的特異性抗體在免疫保護中也起一定作用。
以往曾認為HFRS病人的細胞免疫功能呈抑制狀態，而近年來的研究表明，細胞免疫在對HFRS病毒感染的免疫保護中起同樣起重要作用。特別是觀察到HFRS病人的抑制性T細胞功能低下，致使殺死性T細胞和B細胞功能相對增強，一些細胞因子（如白細胞介素1、干擾素、腫瘤壞死因子、白細胞介素2受體、前裂腺素E2等）的水平在HFRS的不同病期也有明顯變化。值得指出的是，上述細胸免疫（包括一些細胞因子）與特異性抗體一樣，除參與抗感染免疫，具有抵御和清除病毒的作用以外，也參與變態反應，即也可能是造成本病免疫病理捐贈傷的原因之一。
HFRS病后可獲持久免疫力，一般不發生再次感染發病，但隱性感染產生的免疫力多不能持久。