1.重癥肌無力
長期以來人們即發現重癥肌無力與胸腺（或胸腺瘤）有關。重癥肌無力臨床上可分為3型，如眼瞼下垂、視物長久疲勞、復視等為眼肌型；上肢伸舉不能持久、步行稍遠需坐下休息為軀干型；咀嚼吞咽費力，甚至呼吸肌麻痹為延髓型。臨床上最危險的是肌無力危象，患者呼吸肌麻痹必須人工輔助呼吸。
目前認為重癥肌無力是一自身免疫性疾病，主要因胸腺受某種刺激發生突變，多年來一直采用抗乙酰膽堿酯酶藥物治療重癥肌無力，如吡啶斯的明，近年來又加用免疫抑制劑，如激素、環磷酰胺等。
2.單純紅細胞再生障礙性貧血
與胸腺瘤并存疾病之一是單純紅細胞再生障礙性貧血。純紅再障可為原發的，原因不清，也可繼發于藥物、感染和腫瘤。
3.腎病綜合征腎炎
腎病綜合征腎炎與胸腺瘤的關系尚不明了。腎病綜合征可以是某些腫瘤，如霍奇金病全身表現的一部分。可能的解釋是，胸腺瘤與腎小球腎炎的抗原抗體復合物形成交叉反應。