一、調控
脂肪酸合酶的代謝與體內平衡是由上游刺激因子（Upstream Stimulatory Factor）和固醇調節元件結合蛋白（sterol regulatory element binding protein-1c，SREBP-1c）進行轉錄調控，以對進食行為和胰島素做出反應。
二、疾病相關
脂肪酸合酶的基因可能是一個癌基因。在癌癥研究中發現，脂肪酸合酶的水平在乳腺癌中發生上調，它可以作為不準確癌癥診斷的指標，也是化療中的潛在靶標。
