一般繼發于腹膜后臟器的炎癥或穿孔，尤其是腹膜后前間隙內的消化道部分。部分繼發于血源性感染，少數發病原因不明。
1.膽道穿孔膽總管下2/3段位于腹膜后間隙，結石嵌頓壓迫膽總管壁導致其壞死，或膽囊切除、膽總管探查取石時損傷膽總管，可使膽汁漏出并引起膽源性腹膜后膿腫。
2.十二指腸外傷或后壁潰瘍穿孔十二指腸大部分位于腹膜后位，遭受損傷或潰瘍穿孔后如診斷治療延誤，大量消化液可積聚在腹膜后間隙并繼發感染引起腹膜后膿腫。手術探查對十二指腸損傷的漏診以及對十二指腸破裂手術處理不當，可引起十二指腸瘺并導致腹膜后間隙的嚴重感染。此外內鏡檢查或插管時(包括鼻膽管引流)也有可能造成十二指腸后側的微創，尤其內鏡檢查時難免要發生扭轉、壓迫等現象，更易造成十二指腸不同程度的創傷，十二指腸液就有可能滲漏到腹膜后，導致腹膜后間隙感染。
3.結腸炎、損傷穿孔升結腸和降結腸位于腹膜后，其炎癥、外傷穿孔均可引起腹膜后感染并常形成腹膜后膿腫。