1、腦電圖對于腦炎有診斷意義。
2、顱腦CT檢查對于有神經系統體征或并發癥可能時做。能見到蛛網膜下腔出血、腦室擴大、腦腫脹、硬膜下腔積液、腦膿腫、硬膜外膿腫等表現，室管膜炎時腦室周圍低密度異常。3、顱腦MRI能顯示早期腦膜炎腦脊液信號改變，蛛網膜下腔擴張以及彌漫性腦水腫、皮層下梗死及出血，或硬膜下積液等。
腦脊液培養+藥敏試驗--腦脊液培養+藥敏試驗是腦脊液感染時的一種檢查。
腦脊液葡萄糖(CSF-Glu)--腦脊液的一種檢查方法。
腦脊液細胞分類計數--腦脊液的顯微鏡常規檢查，一般以細胞計數和白細胞分類為主。腦脊液不含紅細胞，無白細胞或含極少量的白細胞。有中樞神經系統疾病時，腦脊液中的細胞數增多，白細胞升高的種類發生變化。因此做腦脊液顯微鏡檢查可以反映疾病的不同性質。
腦脊液病原體檢查(CSF)--對有腦膜刺激癥狀、疑為神經系統感染性疾病的病人做腦脊液病原學檢查具有重要意義。
抗乙型腦炎病毒抗體(EPBV-AB)--急性乙型腦炎患者在發病后第七天，可產生特異性抗乙型腦炎病毒抗體IgM(EPBV-IgM)，2～3周達高峰，故檢測EPBV-IgM，有助于對急性乙型腦炎的早期診斷。檢查時靜脈血2ml，不抗凝，分離血清或腦脊液2ml進行測定。