腺病毒腸炎病情不重，一般不治自愈。主要是對癥治療及必要的支持療法。有輕度失水可口服補液，中或重度失水宜靜脈補液。
腺病毒胃腸炎的最小發病年齡為1月，絕數發生于3歲以下的嬰幼兒。Ad-40主要感染1歲左右嬰兒，Ad-41則感染稍大的幼兒，全年均可發病，但腺病毒性胃腸炎一般呈散發性。
腺病毒胃腸炎的潛伏期約10天，主要表現為腹瀉，量少或多，呈水樣便或稀便，少數可排出粘液，病程4～8天，常伴嘔吐。部分患者有呼吸道癥狀，少數患者發熱，病程多自限，排毒時間約1周。某些患者失水較嚴重，個別重度失水者可死亡。
由于對一病毒的致病作用不夠重視，尚無常規細胞培養。診斷本病雖可采用DNA限制性內切酶檢測法，但此法有一定局限性，不易推廣。有人認為采用聚丙烯胺凝膠電泳法既能檢測Ad，又可檢測糞便中輪狀病毒，敏感度高于電鏡。
對本病的治療主要是對癥治療，可口服世界衛生組織推薦的口服補液鹽，必要時給予靜脈補液。