主要與繼發性腹膜炎和結核性腹膜炎相鑒別。
1.繼發性腹膜炎 繼發于外科急腹癥或腹部外科手術后，鑒別要點為：起病急驟，常伴有明顯的膿毒癥表現，急性腹膜刺激征即“腹膜炎三聯征”突出；腹腔穿刺為膿性，可見消化道內容物殘渣，腹水生化葡萄糖降低（L），白蛋白（>10g/L）和LDH(>血清LDH水平) 增高，細菌涂片與培養不是單一細菌，多為混合性細菌感染；X線平片在空腔臟器穿孔時可見膈下游離氣體。必要時行內鏡、腹腔鏡檢查，或行剖腹探查術。
2.結核性腹膜炎 鑒別主要依據：患者多有結核病史或其他部位的結核病灶；可伴有午后潮熱、盜汗等結核中毒癥狀；腹部捫診呈特征性揉面感；腹水淋巴細胞增多、抗酸染色陽性；血沉增快，血清結核抗體陽性；試驗性抗癆治療有效。