艱難梭菌（Clostridium difficile）對氧極為敏感，分離培養較困難．故命名為艱難梭菌。艱難梭菌屬厭氧性細菌。厭氧性細菌是指那些在無氧條件下要比在有氧環境中生長好的細菌，而人的腸道正好是一個相對無氧的環境。
艱難梭菌為革蘭陽性粗大桿菌，有鞭毛，卵圓形芽胞位于次極端。芽胞在外環境可存活數月。分離培養基常用環絲氨酸一甘露醇等特殊培養基。艱難梭菌能形成芽胞，對熱力、干燥、消毒劑等理化因素均有強大的耐受性，在干燥、消毒劑環境中可存活數月，在衣服、家具和環境中廣泛存在。
艱難梭菌是人類腸道正常菌群成員，不規范使用抗生素時，可導致腸道菌群失調。耐藥的艱難梭菌大量生長繁殖，導致抗生素相關性腹瀉和偽膜性腸炎等疾病。