如果被轉移的常染色質區段所包含的基因不止一個，而是兩個以上，那么這幾個基因同樣可以由于位置變換而表現花斑現象。這種由于倒位或易位而使一系列基因同時失活的現象稱為擴散性位置效應。例如果蠅的 X染色體的常染色質區有五個依次排列著的基因座位：粗糙眼（rough,rst）、小糙眼（facet,fa）、小體（diminutive,dm）、海膽眼（echinus,ec）和二裂翅 (bifid,bi）。如果由于染色體倒位而使這些座位的野生型基因順序顛倒并且被連接到接近著絲粒的異染色質區，那么位置效應可自rst座位一直延伸到bi座位，各個基因將表現出不同程度的野生型性狀和突變型性狀相嵌合的花斑現象。在果蠅的唾腺染色體上，這種擴散性位置效應有時可延伸到50個橫紋（相當于大約六個圖距單位）。小鼠常染色體的一些基因如果被易位到X染色體上，那么由于相鄰的異染色質的作用，也表現有不同程度的花斑現象。擴散性位置效應所表現的強弱與各個基因距離異染色質的遠近有關，一般愈接近異染色質區的基因的位置效應愈強，愈遠則位置效應愈微弱。
花斑位置效應比較普遍，但是它所表現的花斑現象經常容易與另一些類似現象相混淆，例如由于體細胞交換而出現的花斑（見連鎖和交換）等。驗證花斑位置效應的方法是通過染色體交換或誘發染色體畸變而使染色體排列恢復原來狀態，然后觀察表型是否同樣恢復正常，如果表型不再呈現花斑狀，那就說明這是一種花斑位置效應。有關果蠅的多毛基因（hairy,h）、白眼基因（w）、小鼠的棕色毛基因 (brown,b）等都曾通過這些方法證明花斑的出現來自位置效應。