葡萄膜惡性黑色素瘤的預后較皮膚惡性黑色素瘤者為好，前者死亡率為50%，而后者可達80%。局部復發或轉移大多發生在術后1年內，個別病例則可延長5年或10年以上。預后和腫瘤細胞類型有密切關系，梭形細胞型死亡率較低，上皮細胞型死亡率較高。
