薄層層析法以吸附層析使用最為普遍。常用的吸附劑為硅膠、氧化鋁等。薄層層析和其他層析法一樣,除吸附法外,也可進行分配、離子交換、分子排阻等機理的層析,即將鋪制薄層的材料相應換為涂以固定相的載體、離子交換劑、凝膠等,其操作與吸附法基本相同。