一、蛋白丟失性胃腸病的診斷：
凡是不明原因的低蛋白血癥，伴有胃腸道疾病的臨床表現，排除肝、腎疾病所致的營養不良或消耗性疾病，即應疑及本病。
蛋白丟失性胃腸病的診斷應包括以下三方面：
1.有低蛋白血癥存在臨床表現為水腫、低血漿蛋白。
2.有蛋白質從胃腸道丟失的證據，糞51Cr白蛋白測定及α1抗胰蛋白酶清除率測定對診斷蛋白質從胃腸道丟失具有較大意義。
3.病因診斷可根據病史、臨床表現和必要的實驗檢查或特殊檢查進行綜合分析判斷。
二、蛋白丟失性胃腸病的鑒別診斷：本病應與肝硬化、腎病綜合征、甲狀腺功能亢進、惡性腫瘤、糖尿病、先天性低白蛋白血癥等病癥鑒別。