腦膿腫可發生兩種危象：
（1）腦疝形成：顳葉膿腫易發生顳葉鉤回疝，小腦膿腫則常引起小腦扁桃體疝，而且膿腫所引起的腦疝較腦瘤者發展更加迅速。有時以腦疝為首發癥狀而掩蓋其它定位征象。
（2）膿腫破裂而引起急性腦膜腦炎，腦室管膜炎：當膿腫接近腦室或腦表面，因用力、咳嗽、腰椎穿刺、腦室造影、不恰當的膿腫穿刺等，使膿腫突然潰破，引起化膿性腦膜炎或腦室管膜炎并發癥。常表現突然高熱、頭痛、昏迷、腦膜刺激癥、角弓反張、癲癇等。其腦脊液可呈膿性，頗似急性化膿性腦膜炎，但其病情更兇險，且多有局灶性神經系統體征。
