對于反復暈厥發作的患兒，經過詳細的詢問病史，了解發作時的癥狀與體征，再通過必要的輔助檢查如心電圖、腦電圖、生化檢查和直立傾斜試驗等手段不難診斷，但要與以下疾病進行鑒別：
1、心源性暈厥
該病是由心臟疾患引起的心排血量突然降低或排血暫停，導致腦缺血所引起。多見于嚴重的主動脈瓣或肺動脈瓣狹窄、心房黏液瘤、急性心肌梗塞、嚴重的心律失常、Q-T間期延長綜合征等疾患。通過仔細詢問病史、體格檢查、心電圖改變等易于鑒別。
2、低血糖癥
本病常有饑餓史或使用降糖藥的病史，主要表現為乏力、出汗、饑餓感，進而出現暈厥和神志不清，暈厥發作緩慢，發作時血壓和心率多無改變，可無意識障礙，化驗血糖降低，靜注葡萄糖迅速緩解癥狀。
3、癲癇
對于表現為驚厥樣暈厥發作的血管迷走性暈厥患兒要注意與癲癇鑒別，通過做腦電圖、直立傾斜試驗的檢查不難鑒別。
4、直立調節障礙
該病患兒表現為由臥位直立瞬間或直立時間稍長可有出現頭暈、眼花、胸悶不適等癥狀，嚴重者可有惡心、嘔吐，甚至暈倒，不需治療能迅速清醒，恢復正常。可通過直立試驗、直立傾斜試驗等加以鑒別。
5、癔病性暈厥
該病發作前有明顯的精神因素，且在人群之前。發作時神志清楚，有屏氣或過度換氣，四肢掙扎亂動，雙目緊閉，面色潮紅。脈搏、血壓均正常，無病理性神經體征，發作持續數分鐘至數小時不等，發作后情緒不穩，如有暈倒，亦緩慢進行，不會受傷，常有類似發作史，易于血管迷走性暈厥鑒別。
此外，本病還要與過度換氣綜合征等鑒別。