衣殼的類型大致是按它們的形態來分類的。不同的病毒可以具有不同形態的衣殼,大多數病毒的衣殼為二十面體形和螺旋形。但也有少量病毒,如噬菌體的衣殼具有較為復雜的結構,其衣殼類型為復合型。
二十面體形：二十面體形衣殼是由二十個三角形面組成的接近于球狀的結構，如腺病毒。二十面體呈現5-3-2對稱，即每個頂點為5重對稱，每個面的中心為3重對稱，每條邊的中心為2重對稱。每一個面可以由一個或多個蛋白質組成（例如口蹄疫病毒的每個面由三個蛋白質組成，V1、V2和V3）。
螺旋形：螺旋形衣殼可以形成中空的圓柱體狀結構，典型的有煙草花葉病毒。
復合型：既非完全的螺旋形又非完全的正二十面體形，可以有附加的結構。以噬菌體的衣殼結構為代表，其頭部為二十面體形，而尾鞘為螺旋形。