貝赫切特綜合征伴發的精神障礙為自體免疫性疾病，病因尚不清。其伴發精神障礙發病的主要因素，導致精神障礙的腦功能紊亂繼發于白塞病。然而并非患白塞病的全部發生精神障礙，故白塞病并非為發生精神障礙的惟一原因。可能尚有其他因素與精神障礙的發生有關，如其他生物學因素，包括患者的性別、年齡、遺傳因素、人格特征，以及既往的神經精神病史等；心理因素則包括應激狀態、長期的心理矛盾等；環境因素，如居住擁擠，環境嘈雜、潮濕，空氣污染等等。以上因素均可成為本病伴發精神障礙的促發因素。
