輸卵管梗阻的原因分為原發性和繼發性輸卵管梗阻。所謂原發性輸卵管梗阻，即先天性的，出生時就有的，這種堵塞極為少見；而繼發性輸卵管梗阻，即是后天性的因素所造成的堵塞非常常見，是因一些疾病因素及人為因素造成的，也是引起輸卵管梗阻的最主要的因素。繼發性的原因分為機械性和病理性。機械性輸卵管梗阻是有一些脫落的栓子及器官的功能性收縮所造成的。
常見的栓子有月經期的內膜碎片、血凝塊，藥物流產由于子宮收縮及流產時的子宮付壓吸引的突然解除引起胚胎組織及胚胎附屬物進入輸卵管造成輸卵管梗阻。還有的是由于輸卵管液的固縮引起輸卵管梗阻，計劃生育中所進行的輸卵管粘堵術等；輸卵管受到一些刺激時會發生功能性痙攣致開口及管腔收縮而形成輸卵管的梗阻．這樣造成輸卵管梗阻的機會還是少見的，主要見于在不孕癥病因尋找時進行輸卵管通暢性檢查時所引起，如輸卵管通液檢查，輸卵管造影檢查，腹腔鏡下輸卵管美蘭通液等，由于醫生技術操作粗暴，技術操作不成熟；或由于患者自身對痛疼過于敏感等所引起，此種情況在經X線的子宮輸卵管造影檢查片子的閱讀時有經驗的輸卵管專業醫生可以通過特殊的造影影像學表現來進行診斷。
最常見的輸卵管梗阻的原因是病理性的不通。病理性多數則由輸卵管病變引起，最常見的是輸卵管出現炎性病變，輸卵管炎的病因是由于病原體感染引起,病原體主要有葡萄球菌、鏈球菌、大腸桿菌、淋球菌、變形桿菌、肺炎球菌、衣原體等所引起，這種炎癥往往是一過性的，短暫的，但由于感染性炎癥所引起的輸卵管梗阻將是永久性的，不可自愈的。輸卵管梗阻的臨床表現：輸卵管梗阻沒有明顯的臨床自覺癥狀，主要表現為不孕，部分輸卵管傘端積水的患者有慢性腹痛的表現。