過氧化物酶體是由一層單位膜包裹的囊泡，直徑約為0.5～1.0μm，通常比線粒體小。普遍存在于真核生物的各類細胞中，在肝細胞和腎細胞中數量特別多。過氧化物酶體的標志酶是過氧化氫酶，它的作用主要是將過氧化氫水解。過氧化氫（H2O2）是氧化酶催化的氧化還原反應中產生的細胞毒性物質，氧化酶和過氧化氫酶都存在于過氧化物酶體中，從而對細胞起保護作用。
植物體中含有大量過氧化物酶體，是活性較高的一種酶。它與呼吸作用、光合作用及生長素的氧化等都有關系。在植物生長發育過程中它的活性不斷發生變化。一般老化組織中活性較高，幼嫩組織中活性較弱。這是因為過氧化物酶能使組織中所含的某些碳水化合物轉化成木質素，增加木質化程度，而且發現早衰減產的水稻根系中過氧化物酶的活性增加，所以過氧化物酶可作為組織老化的一種生理指標。此外，過氧化物同工酶在遺傳育種中的重要作用也正在受到重視。