鉤體病的潛伏期為1～2周，最長可達4周，早期可出現發熱，肌痛(尤其是腓腸肌疼痛和壓痛)，全身乏力，眼結膜充血及淋巴結腫大，具有特征性的三癥狀，三體征的感染中毒表現，患者常于病程3～10天出現器官損害癥狀，按不同的臨床表現可分為流感傷寒型，肺出血型，黃疸出血型，腎功能衰竭型及腦膜腦炎型等，其中肺出血型又可分為普通肺出血型和肺彌漫性出血型，后者病情兇險，病死率高。
鉤體病相關腎病可伴隨流感傷寒型，黃疸出血型鉤體病發生，若單獨出現，即為腎功能衰竭型，臨床表現主要以少尿，蛋白尿，尿中有少量白細胞，紅細胞，管型等，少數嚴重患者病情呈進行性加重，出現無尿，酸中毒，腎功能衰竭，尿毒癥，鉤體病相關腎病一般預后較好，多數病人通過少尿期，多尿期而恢復。