正常人常暴露于新生隱球菌的環境中,但發病者極少,人體對隱球菌的免疫包括細胞免疫與體液免疫。巨噬細胞、中性粒細胞、淋巴細胞、自然殺傷細胞起著重要作用。體液免疫包括:抗莢膜多糖抗體以及補體參與調理吞噬作用,協助吞噬細胞吞噬隱球菌。只有當機體抵抗力降低時,病原菌才易于侵入人體而致病。