1、外源DNA片段的全克隆
根據外源DNA片段的末端性質及大小確定克降載體,鳥槍法一般選擇質粒或入-DNA作為克隆載體,受體細胞大多選擇大腸桿菌,只有當后續篩選必須采用外源基因表達產物檢測法時才選擇那些能使外源基因表達的相應受體系統 [1]。
2、目的重組子的篩選
從眾多的鳥槍法克隆中快速檢出目的重組子的最有效手段是菌落(菌斑)原位雜交法或外源基因產物功能檢測法,前者需要理想的探針,后者則依賴于簡便篩選型的建立。如前所述,若克隆淀粉酶、蛋白或抗生素抗性基因,利用外源基因產物功能檢測法篩選目的重組子是最理想的選擇。在既無探針又難以建立快速篩選模型的情況下,也可采用限制性酶切圖譜法對所獲重組克隆進行分批篩選。例如,已知目的基因位于2.8kb的 ECORI DNA片段中,可用 ECORI分別酶解所有的重組分子,初步確定含2.8kb限制性插入片段的重組克隆,然后再根據目的基因內部的特征性限制性酶切位點進行第二輪酶切篩選,最終找到目的重組子 [1]。
3、目的基因的定位
在絕大多數情況下,利用鳥槍法獲得的目的重組子只是包含目的基因的DNA片段,必須通過次級克隆在已克隆的DNA片段上準確定位目的基因,然后對目的基因進行序列分析,搜尋其編碼序列以及可能存在的表退染色體DNA調控序列。鳥槍法克隆目的基因的工作量之大是可想而知的,對目的基因及其編碼產物的性質了解得越詳盡,工作量越小 [1]。
1999年,Yates研究組提出“鳥槍法”(shotgun),其基本技術路線是針對液體或SDS-PAGE條帶的復雜混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物,然后對肽混合物進行多維毛細管液相色譜分離......
【摘要】鳥槍法串聯質譜蛋白質鑒定策略由于其高可靠和高效率而被廣泛應用于蛋白質組學研究中,這種方法直接對蛋白質混合物進行酶切,以肽段為鑒定單元,繼而推導真實的樣品蛋白質。由于利用質譜圖推導肽段存在一定的......
摘要蛋白質定量是探索疾病發生發展狀況和尋找新藥靶標的重要手段。在shotgun蛋白組學中,目前常用定量方法包括綜合同位素標記后的質譜峰強度方法和無標記定量方法。根據數據類型無標記定量方法可以分為兩類:......
摘要細胞質膜是細胞中重要的細胞器,在肝功能的發揮中具有非常重要的作用.使用蔗糖密度梯度離心純化細胞質膜,通過電子顯微鏡觀察和免疫印跡法檢驗膜的純度.結果顯示,與組織勻漿成分相比,質膜富集了20倍,線粒......