臨床表現黏液腺囊腫位于黏膜下，約黃豆大小，呈半透明的無痛小皰。破裂后可流出黏液，腫脹消退，但不久又可復發。多次復發后，囊腫表面常因疤痕而呈灰白色。治療常以外科手術切除法和碘酊注入療法。
黏液腺囊腫可發生于三對大涎腺及所有小涎腺，有潴留性囊腫及先天性囊腫兩種類型，潴留性囊腫最多見，其常發生于舌下腺及小涎腺，其次為腮腺，頜下腺囊腫非常少見，是由于導管縮窄，或腫瘤、牙結石、損傷、寄生蟲等造成導管阻塞所致，這種情況是一種間斷的阻塞，在沒有炎癥時，導管的近心端腺泡擴張，形成潴留囊腫。先天性囊腫多見于腮腺，是由于胚胎發育時期遺留于深部組織內的上皮成分發展而成，發生于小涎腺的潴留囊腫稱為黏液腺囊腫，發生于其余涎腺的囊腫則按其發病部位命名，即舌下腺囊腫、頜下腺囊腫及腮腺囊腫。